建设世界一流学科需要科学有效的学科评估为其战略选择提供判断依据。然而，作为学科建设的基本原则．“以评促建”在实践过程中却出现了较大的偏差：其一，评估主体秉承“构成论”思维方式．掩盖了一流学科的整体状态和潜在内涵；其二，办学者坚持“还原论”的建设方式，忽视了学科发展机理和现代学术制度：其三，“以评促建”有其自身的效用边界，“竞争选优”不利于国家意志的有效体现。研究认为，世界一流学科是在卓越的学科理念、历史传统、文化信念的基础上自组织形成的，其特殊的生长方式要求重塑“以评促建”的合法性基础。转向“整体论”的学科评估方式，通过加强诊断式评估来养成能够持续改进的质量文化；转向“生成论”的学科建设方式，通过尊重学术研究的基本规律来激发学科组织的生长动力：重塑跨学科研究与学科建设的关系．通过发挥跨学科研究和教育的重要作用。建构协同有序的学科生态互动机制。