在解析大学制度的内涵以及大学制度与大学的绩效关联、重新考察大学的组织特性的基础上，提出分析现代大学制度的实践逻辑。现代大学制度是现代大学的基本限定，现代性是不断建构和改造的过程：现代大学是高度复杂的组织，大学组织制度受国家制度和文化的影响；学术人和行政人是大学的基本构成，在行为指令方面存在差异；大学学术人既遵从经济人、政治人的人性假设规律，也有学术人独特的假设特点；大学内部成员的行为和大学制度相互作用．实践逻辑要求将大学成员的行为纳入大学制度的考察视阈；现代大学制度的完善和改革如果不能落到行为和惯习的层面．就不可能成功。